ffmpegを使い、動画ファイルをWindowsなどで無難に再生できる h264 コーデックに変換する方法です。
基本的にffmpegは出力ファイル名に～.mp4と指定すれば、コーデックもある程度自動判別して h264になることがほとんどです。そういう意味では、以下の記述書式はあまり必要ないかもしれません。
それでもあえてコーデックをh264に限定したい場合は以下を使ってみてください。
記述書式
ffmpeg -i 《変換したいファイル名》 -codec:v h264 《変換後のファイル名》
ちなみに-codecは-cと省略して記述もできるので以下も同じ意味となります。
ffmpeg -i 《変換したいファイル名》 -c:v h264 《変換後のファイル名》
例として abc.m4aのファイルを（コーデックが何であれ）h264コーデックに変換してhoge.mp4で出力する場合は以下のようになります。
ffmpeg -i abc.m4a -codec:v h264 hoge.mp4
または
ffmpeg -i abc.m4a -c:v h264 hoge.mp4
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